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【学术报告】2018年1月26日下午胡学海副教授来我院举办学术讲座

2018-01-25 15:02:14    浏览次数:

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报告人:胡学海(华中农业大学)

报告题目:分形与序列复杂度方法在生物信息学中的应用

报告摘要:2003年人类基因组计划的完成,催生了基因组学与生物信息学两个前沿研究领域,生物学研究进入了后基因组时代。特别是随着ENCODE、Epigenome Roadmap等后续研究计划的推进,基因组中非编码DNA调控元件的转录调控作用以及相关的表观遗传调控机制成为当前生物信息学研究的热点。我们提出使用分形与序列复杂度等数学工具,包括混沌图表示、分形维数、序列的因子复杂度、拓扑熵、序列的阿贝尔复杂度等方法,量化提取启动子、增强子、DNA甲基化等DNA调控元件的本质特征,并基于此构建它们的全基因组预测模型,为它们的转录调控功能研究提供支撑与帮助。

报告人简介:胡学海,男,副教授。曾任华中农业大学理学院数学与统计系主任,现任华中农业大学信息学院大数据科学系主任。研究领域为分形几何学与生物信息学,多年来致力于探索分形与序列复杂度方法在生物信息领域,如全基因组DNA调控元件预测、功能蛋白质与功能基因的预测等方面的应用研究。主要研究内容包括基于序列因子复杂度方法的DNA甲基化的全基因组预测,基于联合三元组特征与分形特征的核受体蛋白预测,基于分形特征的DNA结合蛋白质预测,基于混合分形方法的耐热基因预测、基于分形维数的耐热蛋白质预测等。主持完成国家自然科学基金青年基金一项,目前主持在研国家自然科学基金面上项目一项。在BMC Bioinformatics、International Journal of Molecular Sciences、Journal of Theoretical Biology、Acta Arithmetica等国际SCI刊物上已发表科研论文20余篇。担任BMC Genomics、BMC Bioinformatics、IEEE Computational Biology等多个SCI期刊的审稿人。

报告时间:2018年1月26日(星期五)下午3:00-4:00

报告地点: 科技楼南楼602室